第一条主线围绕着水族与陆地妖族的故事展开。于水族修道者修行至关重要的化龙池干枯，便有想修为更进一步的水族寻道教圣地三清山的丹药突破。龙九（龙鲤）因身负龙族血脉求丹途中被盘山洞万蛇老祖所擒欲吞其血肉，被困时得玄麟解救，同时表兄敖泽前往营救。由此引出了敖泽（黄龙），玄麟（玄蛇），映修（古丹井井仙）等人的生死情仇。 第二条主线围绕着三清山在宗门地界与妖族对抗的同时，试图抵御卷土重来、意图借着因云坤真人